Hay dos métodos que guardan los cambios a los documentos PDF : los métodos son Zend_Pdf::save() y Zend_Pdf::render() .

Zend_Pdf::save($filename, $updateOnly = false) guarda el documento PDF en un archivo. Si $updateOnly es TRUE, sólo entonces el nuevo segmento del archivo PDF se agrega al archivo. De lo contrario, el archivo es sobreescrito.

Zend_Pdf::render($newSegmentOnly = false) regresa el documento PDF como un string. Si $newSegmentOnly es verdadero, entonces sólo el nuevo segmento del archivo PDF es devuelto.

...
// Cargar el documento PDF
$pdf = Zend_Pdf::load($fileName);
...
// Actualizar el documento PDF
$pdf->save($fileName, true);
// Save document as a new file
$pdf->save($newFileName);

// Devolver el documento PDF como un string
$pdfString = $pdf->render();

...